Η εφαρμογή πολλές φορές όπως λέγουν ανά διαστήματα δεν λειτουργούσε βγάζοντας μηνύματα σφαλμάτων ενώ την ίδια στιγμή η τηλεφωνική εξυπηρέτηση που παρέχει η ΓΓΔΕ είναι «δυσπρόσιτη».
Το πρόβλημα το είχε επισημαίνει εγκαίρως η ΠΟΦΕΕ ζητώντας άμεσα την παράταση της προθεσμία για ένα μήνα αλλά προς το παρόν δεν υπάρχει ενημέρωση για το τι θα γίνει. Στην επιστολή της ΠΟΦΕΕ προς το Υπ. Οικονομικών υπογραμμιζόταν πως "λόγω των πολλαπλών φορολογικών και ασφαλιστικών υποχρεώσεων που έχει ο κλάδος στη παραπάνω ημερομηνία (30/9/2016) και για το λόγο ότι δεν υπάρχει δημοσιονομικό κόστος για το συγκεκριμένο θέμα, η Π.Ο.Φ.Ε.Ε. θεωρεί ότι πρέπει η ημερομηνία 30 Σεπτεμβρίου 2016 να μετατεθεί μέχρι 31 Οκτωβρίου 2016, παραμένοντας η οριστική λήξη υποβολής μετά από διορθώσεις η 30η Νοεμβρίου 2016".
Πάντως η ταλαιπωρία υποβολής των δηλώσεων θα συνεχιστεί και τη νέα χρονιά. Με το νέο καθεστώς από το 2017 οι καταστάσεις θα υποβάλλονται μέχρι το τέλος Φεβρουαρίου του επόμενου έτους από το ημερολογιακό έτος, στο οποίο αφορούν. Τροποποιητική δε δήλωση για τη διόρθωση αποκλίσεων στα υποβληθέντα στοιχεία προμηθευτών μπορεί να υποβληθεί μέχρι το τέλος Απριλίου του επόμενου έτους. Το υπουργείο πάντως εκτιμά πως με τη νέα διαδικασία θα μπει μια σειρά καθότι τα τελευταία χρόνια οι παρατάσεις που δίνονταν ήταν πολλές.