Οι πέντε άνδρες επρόκειτο να πραγματοποιήσουν πτήση παρακολούθησης των δικτύων διακίνησης μεταναστών και ναρκωτικών και να επιστρέψουν στη Μάλτα έπειτα από λίγες ώρες, όμως το αεροσκάφος που τους μετέφερε συνετρίβη λίγα δευτερόλεπτα με την απογείωση στις 07.20 τοπική ώρα. Οι πρώτες αναφορές από το Reuters ήθελαν στο αεροσκάφος να επέβαιναν στελέχη της Frontex, της ευρωπαϊκής υπηρεσίας για συνοριοφυλακή, που θα ταξίδευαν στη Λιβύη, αλλά η Frontex διέψευσε πως το είχε ναυλώσει.
Στη συνέχεια, η Frontex ανακοίνωσε επίσης πως δεν επέβαιναν στελέχη της Frontex στο αεροσκάφος. Σύμφωνα με μαρτυρίες που επικαλούνται ΜΜΕ στη Βαλέτα, όπως οι Times of Malta, αμέσως μετά την απογείωσή του από τον διάδρομο το αεροσκάφος, ένα Metroliner, άρχισε να γέρνει στη δεξιά του πλευρά. Πηγή από το αεροδρόμιο που επικαλείται το Reuters ανέφερε πως οι επιβαίνοντες ήταν Γάλλοι. H ύπατη εκπρόσωπος της ΕΕ για Εξωτερικές Υποθέσης, Φραντσέσκα Μογκερίνι, ανέφερ επως η πτήση δεν είχε σχέση με δραστηριότητες της ΕΕ.
