Οι ημερομηνίες διεξαγωγής των τριών αγωνιστικών για τη 2η φάση του Κυπέλλου Επαγγελματικών Ομάδων περιόδου 2015-2016, είναι 27-29/10/2015 (1η), 1-3/12/2015 (2η) και 15-17/12/2015 (3η) ενώ οι όμιλοι που προέκυψαν είναι οι παρακάτω.
1ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: ΠΑΣ Γιάννινα, Ηρακλής, Αχαρναϊκός, Αναγέννηση Καρδίτσας.
1η: ΠΑΣ Γιάννινα-Ηρακλής, Αναγέννηση Καρδίτσας-Αχαρναϊκός
2η: Αχαρναϊκός-ΠΑΣ Γιάννινα, Ηρακλής-Αναγέννηση Καρδίτσας
3η: Αχαρναϊκός-Ηρακλής, Αναγέννηση Καρδίτσας-ΠΑΣ Γιάννινα
2ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: Παναιτωλικός, Πανιώνιος, Εργοτέλης, Ζάκυνθος
1η: Παναιτωλικός-Πανιώνιος, Ζάκυνθος- Εργοτέλης
2η: Εργοτέλης-Παναιτωλικός, Πανιώνιος-Ζάκυνθος
3η: Εργοτέλης-Πανιώνιος, Ζάκυνθος-Παναιτωλικός
3ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: ΠΑΟΚ, Πανθρακικός, Χανιά, Ολυμπιακός Βόλου
1η: ΠΑΟΚ-Πανθρακικός, Ολυμπιακός Βόλου-Χανιά
2η: Χανιά- ΠΑΟΚ, Πανθρακικός-Ολυμπιακός Βόλου
3η: Χανιά-Πανθρακικός, Ολυμπιακός Βόλου-ΠΑΟΚ
4ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: Παναθηναϊκός, Λεβαδειακός, Παναχαϊκή, Κασσιόπη
1η: Παναθηναϊκός-Λεβαδειακός, Κασσιόπη-Παναχαϊκή
2η: Παναχαϊκή-Παναθηναϊκός, Λεβαδειακός-Κασσιόπη
3η: Παναχαϊκή-Λεβαδειακός, Κασσιόπη-Παναθηναϊκός
5ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: Ολυμπιακός, Πλατανιάς, Παναιγιάλειος, Απόλλων Σμύρνης
1η: Ολυμπιακός-Πλατανιάς, Απόλλων Σμύρνης-Παναιγιάλειος
2η: Παναιγιάλειος-Ολυμπιακός, Πλατανιάς-Απόλλων Σμύρνης
3η: Παναιγιάλειος-Πλατανιάς, Απόλλων Σμύρνης-Ολυμπιακός
6ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: Ατρόμητος, Βέροια, Λαμία, Καλλιθέα
1η: Ατρόμητος-Βέροια, Καλλιθέα-Λαμία
2η: Λαμία-Ατρόμητος, Βέροια-Καλλιθέα
3η: Λαμία-Βέροια, Καλλιθέα-Ατρόμητος
7ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: SKODA Ξάνθη, ΑΕΚ, Λάρισα, Πανελευσινιακός
1η: SKODA Ξάνθη-ΑΕΚ, Πανελευσινιακός-Λάρισα
2η: Λάρισα-SKODA Ξάνθη, ΑΕΚ-Πανελευσινιακός
3η: Λάρισα-ΑΕΚ, Πανελευσινιακός-SKODA Ξάνθη
8ος ΟΜΙΛΟΣ
Ομάδες: Αστέρας Τρίπολης, Καλλονή, Κισσαμικός, Πανσερραϊκός
1η: Αστέρας Τρίπολης-Καλλονή, Πανσερραϊκός-Κισσαμικός
2η: Κισσαμικός-Αστέρας Τρίπολης, Καλλονή-Πανσερραϊκός
3η: Κισσαμικός-Καλλονή, Πανσερραϊκός-Αστέρας Τρίπολης
