Ο «Δικέφαλος του βορρά» κληρώθηκε στον 6ο όμιλο, στο πλαίσιο του οποίου θα αναμετρηθεί με την Κοπεγχάγη από τη Δανία, τη Σλόβαν Μπρατισλάβα από τη Σλοβακία και τη Λίνκολν Ρεντ Ιμπς από το Γιβραλτάρ. Οι Θεσσαλονικείς θα δώσουν το πρώτο παιχνίδι τους στους ομίλους στις 16 Σεπτεμβρίου, ενώ η τελευταία αναμέτρησή τους σε αυτήν τη φάση της διοργάνωσης είναι προγραμματισμένη για τις 9 Δεκεμβρίου. Οι υπόλοιπες πέντε αγωνιστικές θα διεξαχθούν στις 30 Σεπτεμβρίου, στις 21 Οκτωβρίου, στις 4 Νοεμβρίου, στις 25/11 και στις 9 Δεκεμβρίου.
Αξίζει να σημειωθεί ότι οι ομάδες που θα κατακτήσουν την πρώτη θέση στους ομίλους του Europa Conference League προκρίνονται στη φάση των «16». Από την πλευρά τους, οι δεύτεροι των ομίλων του Europa Conference League πηγαίνουν στον «νοκ άουτ» γύρο των πλέι οφ, όπου θα ενταχθούν και οι ομάδες που κατέλαβαν την τρίτη θέση στη φάση των ομίλων του Europa League.
Τα γκρουπ που προέκυψαν από την κλήρωση για τη φάση των ομίλων του Europa Conference League έχουν ως εξής:
1ος ΟΜΙΛΟΣ
Λίντσερ (Αυστρία)
Μακάμπι Τελ Αβίβ (Ισραήλ)
Αλασκέρτ (Αρμενία)
Ελσίνκι (Φινλανδία)
2ος ΟΜΙΛΟΣ
Γάνδη (Βέλγιο)
Παρτιζάν (Σερβία)
Φλόρα Ταλίν (Εσθονία)
Ανόρθωση (Κύπρος)
3ος ΟΜΙΛΟΣ
Ρόμα (Ιταλία)
Ζόρια Λουχάνσκ (Ουκρανία)
ΤΣΣΚΑ Σόφιας (Βουλγαρία)
Μπόντο Γκλιμτ (Νορβηγία)
4ος ΟΜΙΛΟΣ
Αλκμάαρ (Ολλανδία)
Κλουζ (Ρουμανία)
Γιάμπλονετς (Τσεχία)
Ράντερς (Δανία)
5ος ΟΜΙΛΟΣ
Σλάβια Πράγας (Τσεχία)
Φέγενορντ (Ολλανδία)
Ουνιόν Βερολίνου (Γερμανία)
Μακάμπι Χάιφα (Ισραήλ)
6ος ΟΜΙΛΟΣ
Κοπεγχάγη (Δανία)
ΠΑΟΚ (Ελλάδα)
Σλόβαν Μπρατισλάβα (Σλοβακία)
Λίνκολν Ρεντ Ιμπς (Γιβραλτάρ)
7ος ΟΜΙΛΟΣ
Τότεναμ (Αγγλία)
Ρεν (Γαλλία)
Φίτεσε (Ολλανδία)
Μούρα (Σλοβενία)
8ος ΟΜΙΛΟΣ
Βασιλεία (Ελβετία)
Καραμπάγκ (Αζερμπαϊτζάν)
Καϊράτ Αλμάτι (Καζακστάν)
Ομόνοια (Κύπρος)
