Στον 2ο όμιλο τον αποκλεισμό γνώρισε ο Ολυμπιακός Βόλου από τον Απόλλωνα Λάρισας, ενώ το Πιερικός - Πύδνα Κίτρους κρίθηκε στα πέναλτι (9-10!).
Η Παναχαϊκή στον 3ο όμιλο εξασφάλισε την πρόκριση απέναντι στον Τσικλητήρα Πύλου με δυσκολία, στα πέναλτι. Στον 4ο όμιλο ο Εργοτέλης χρειάστηκε τα πέναλτι για να ξεπεράσει το εμπόδιο της ΑΕΕΚ ΙΝΚΑ (10-11), ενώ ο Ιωνικός έμεινε εκτός από τον Ηλυσιακό.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα:
1ος ΟΜΙΛΟΣ
1η αγωνιστική
16. Ορφέας Ξάνθης - ΑΕ Ποντίων Βατολάκκου 3-2
17. ΑΟ Καρδίας - Αλμωπός Αριδαίας 0-2 (0-0 κ.α., παρ.)
18. Μακεδονικός Φούφα - Λαγκαδάς 0-1
19. Απόλλων Καλαμαριάς - Δόξα Δράμας 1-0 παρ. (0-0 κ.α.)
20. Καμπανιακός - Νέστος Χρυσούπολης 4-5 πέν. (3-3 κ.α., παρ.)
21. Δόξα Προσκυνητών – Εορδαϊκός 2-1
22. Νάουσα - Απόλλων Παραλιμνίου 2-1
*Η Καβάλα πέρασε άνευ αγώνος
2η αγωνιστική (13/11)
23. Νέστος Χρυσούπολης - Απόλλων Καλαμαριάς
24. Ορφέας Ξάνθης - Δόξα Προσκυνητών
25. Καβάλα - Αλμωπός Αριδαίας
26. Λαγκαδάς - Νάουσα
3η αγωνιστική (14/12)
27. Νικητής 23 - Νικητής 24
28. Νικητής 26 - Νικητής 25
Τελικός σε ουδέτερη έδρα (22/02/2017)
Νικητής 28 - Νικητής 27
2ος ΟΜΙΛΟΣ
1η αγωνιστική
17. ΑΕ Καραϊσκάκης - Φιλιππιάδα 1-0
18. ΑΕ Ιστιαίας - Ρήγας Φεραίος 2-1
19. Ολυμπιακός Β. - Απόλλων Λάρισας 0-2
20. Νίκη Βόλου - Θεσπρωτός 3-0
21. Αστέρας Πετριτή - Μ. Αετοί Ελευθεροχωρίου 0-3
22. Τηλυκράτης - Διαγόρας Σεβαστής 2-1
23. Αμβρακία Κωστακίων - Αχιλλέας Νεοκαισάρειας 3-0 πεν. (1-1 κ.α., παρ.)
24. Πιερικός - Πύδνα Κίτρους 9-10 πέν. (0-0 κ.α., παρ.)
2η αγωνιστική (13/11)
25. Αμβρακία Κωστακίων - Απόλλων Λάρισας
26. Πύδνα Κίτρους - Τηλυκράτης
27. ΑΕ Καραϊσκάκης - Μ. Αετοί Ελευθεροχωρίου
28. Νίκη Βόλου - ΑΕ Ιστιαίας
3η αγωνιστική (14/12)
29. Νικητής 25 - Νικητής 27
30. Νικητής 26 - Νικητής 28
Τελικός σε ουδέτερη έδρα (22/02/2017)
Νικητής 29 - Νικητής 30
3ος ΟΜΙΛΟΣ
1η αγωνιστική
16. Χαλκίδα – Αχαϊκή 2-3
17. Ζευγολατιό – Θήβα 4-3 παρ. (3-3 κ.α.)
18. Τσικλητήρας Πύλου – Παναχαϊκή 1-3 πέν. (1-1 κ.α., παρ.)
19. Παναρκαδικός - Δόξα Μεγαλόπολης 1-0
20. Παναργειακός – Ερμιονίδα 3-1
21. Αστέρας Αμαλιάδας – Λουτράκι 3-0
22. ΠΑΟ Βάρδας – Αιολικός 2-3
*Ο Φωστήρας πέρασε άνευ αγώνος
2η αγωνιστική (13/11)
23. Αχαϊκή - Φωστήρας
24. Ζευγολατιό - Παναργειακός
25. Αστέρας Αμαλιάδας - Παναρκαδικός
26. Παναχαϊκή - Αιολικός
3η αγωνιστική (14/12)
27. Νικητής 24 - Νικητής 26
28. Νικητής 25 - Νικητής 23
Τελικός σε ουδέτερη έδρα (22/02/2017)
Νικητής 27 - Νικητής 28
4ος ΟΜΙΛΟΣ
1η αγωνιστική
16. Ρόδος – Ιάλυσος 2-1
17. Ατσαλένιος - Ερμής Ζωνιανών 2-1
18. ΑΕΕΚ ΙΝΚΑ - Εργοτέλης 10-11 πέν. (1-1 κ.α., παρ.)
19. Κηφισιά - Προοδευτική 4-0
20. Ηλυσιακός - Ιωνικός 4-2 πέν. (2-2 κ.α., παρ.)
21. Άγιος Ιερόθεος - Θύελλα Ραφήνας 1-0
22. Τριγλία Ραφήνας - Εθνικός 1-0
*Ο Πανθηραϊκός πέρασε άνευ αγώνος
2η αγωνιστική (13/11)
23. Άγιος Ιερόθεος - Τριγλία Ραφήνας
24. Εργοτέλης - Κηφισιά
25. Πανθηραϊκός - Ρόδος
26. Ηλυσιακός - Ατσαλένιος
3η αγωνιστική (14/12)
27. Νικητής 23 - Νικητής 24
28. Νικητής 25 - Νικητής 26
Τελικός σε ουδέτερη έδρα (22/02/2017)
Νικητής 27 - Νικητής 28
