Ο Ιωάννης Παπαϊωάννου, με καταγωγή από τα Τρίκαλα, σπούδασε Πολιτικός Μηχανικός στο Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Ήταν μέλος του ΤΕΕ από το 1964 και διετέλεσε μέλος της Αντιπροσωπείας από το 1991 ως το 2002 και μέλος της Διοικούσας Επιτροπής του Τμήματος από το 1991 ως το 1994. Είχε εργαστεί ως μηχανικός στο Δημόσιο από το 1965 έως το 1973 σε διάφορες περιοχές και ακολούθως ως το 2008 ως ελεύθερος επαγγελματίας στη Λάρισα.
Από το 1978, παράλληλα με τις λοιπές ασχολίες του, ο Γιάννης Παπαϊωάννου ασχολήθηκε με την έρευνα της σεισμικής ιστορίας της Κεντρικής Ελλάδας. Έχει δημοσιεύσει σε περιοδικά και εφημερίδες της Θεσσαλίας και της Φθιώτιδας δεκάδες μελέτες και άρθρα, για σεισμούς, πολλοί από τους οποίους ήταν άγνωστοι μέχρι τότε. Στο Θεσσαλικό Ημερολόγιο είχε δημοσιεύσει για τη σεισμική ιστορία της Θεσσαλίας από το έτος 1500 μέχρι το 1950. Σε συνεργασία με καθηγητές Σεισμολογίας είχε δημοσιεύσει ανακοίνωση στο Ευρωπαϊκό Συνέδριο Σεισμολογίας το 1994 και στο Διεθνές Συνέδριο της Ελληνικής Γεωλογικής Εταιρείας το 2004 για τους σεισμούς στην Κεντρική Ελλάδα.
Στις 5 Δεκεμβρίου 2018 είχε παρουσιαστεί στο «Χατζηγιάννειο» το βιβλίο του με τίτλο «Ο σεισμός της Λάρισας της 1ης Μαρτίου 1941» σε έκδοση του Δήμου Λαρισαίων σε εκδήλωση που διοργάνωσε η Αντιδημαρχία Πολιτικής Προστασίας και οι Σύλλογοι Αρχιτεκτόνων και Πολιτικών Μηχανικών όπου είχαν μιλήσει ο Παναγιώτης Καρύδης, ομότιμος καθηγητής Αντισεισμικών Κατασκευών και ιδρυτής του Εργαστηρίου Αντισεισμικής Τεχνολογίας του Ε.Μ.Π., ο Σπύρος Παυλίδης ομότιμος καθηγητής Γεωλογίας του Α.Π.Θ. και πρόεδρος της Ελληνικής Γεωλογικής Εταιρείας και ο Γεράσιμος Παπαδόπουλος, διευθυντής Ερευνών στο Γεωδυναμικό Ινστιτούτο του Εθνικού Αστεροσκοπείου Αθηνών.