Το άγγελμα του θανάτου σκόρπισε θλίψη στην πανεπιστημιακή κοινότητα. Το Πανεπιστήμιο εξέδωσε συλληπητήρια ανακοίνωση στην οποία αναφέρει: «Το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας θρηνεί την απώλεια του Ιωάννη Παναπακίδη, Επίκουρου Καθηγητή του Τμήματος Ηλεκτρολόγων Μηχανικών και Μηχανικών Υπολογιστών του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας. Ο Ιωάννης Παναπακίδης ήταν Διπλωματούχος Ηλεκτρολόγος Μηχανικός και Μηχανικός Υπολογιστών (Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης) και Δρ Ηλεκτρολόγος Μηχανικός και Μηχανικός Υπολογιστών (Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης) με πλούσιο ερευνητικό έργο και εκτεταμένη διδακτική συνεισφορά.
Η ακαδημαϊκή κοινότητα του Τμήματος θα τον θυμάται με εκτίμηση και αγάπη για την εργατικότητά του, το ήθος του και την ευγένειά του απέναντι σε όλα τα μέλη της.
Η Πρυτανική Αρχή και τα μέλη του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας απευθύνουν θερμά συλλυπητήρια στην οικογένεια του εκλιπόντος».