Ο εμβληματικός αρχηγός της Εθνικής ομάδας στο ποδοσφαιρικό έπος του 2004, έλαβε 66 από τις 68 ψήφους. Η παρουσία του Ζαγοράκη στον προεδρικό θώκο, χαίρει της απόλυτης εκτίμησης του ελληνικού ποδοσφαίρου, στο σύνολό του, ενώ υπενθυμίζεται ότι πρόσφατα τη χαιρέτισαν, τόσο ο πρωθυπουργός, Κυριάκος Μητσοτάκης, όσο και ο υφυπουργός Αθλητισμού, Λευτέρης Αυγενάκης, ο οποίος στο συγχαρητήριο μήνυμά του, επισήμανε χαρακτηριστικά: «Συγχαρητήρια στον οικουμενικό Θοδωρή Ζαγοράκη, νέο πρόεδρο ΕΠΟ. Ως αρχηγός οδήγησε την Εθνική στο έπος Euro 2004, ως επικεφαλής καλείται τώρα να οδηγήσει στην ανασυγκρότηση του ποδοσφαίρου μας με την εφαρμογή Ολιστικής Μελέτης της FIFA και της UEFA. Καλή επιτυχία στη νέα διοίκηση». Η ανακοίνωση για την εκλογή του Ζαγοράκη, που αναρτήθηκε στην ιστοσελίδα της ΕΠΟ, έχει ως εξής: «Ο εμβληματικός αρχηγός της πρωταθλήτριας Ευρώπης του 2004 Εθνικής μας Ομάδας, Θεόδωρος Ζαγοράκης, εξελέγη σήμερα 31ος πρόεδρος της Ελληνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας. Στην τακτική εκλογική Γενική Συνέλευση της ΕΠΟ, που διεξήχθη σήμερα με συμμετοχή 66 εκπροσώπων Ενώσεων Ποδοσφαιρικών Σωματείων, Ποδοσφαιρικών Ανωνύμων Εταιρειών και Επαγγελματικών Λιγκών, και για πρώτη φορά στην ιστορία της Ομοσπονδίας με τη χρήση σύγχρονων μέσων τεχνολογίας, πληροφορίας και επικοινωνίας, ο κ. Ζαγοράκης έλαβε -επί 68 ψηφισάντων- 66 ψήφους, ενώ βρέθηκαν και 2 λευκά. Πριν την έναρξη της ψηφοφορίας, ο ανθυποψήφιός του πρόεδρος της ΕΠΣ Βοιωτίας κ. Κωνσταντίνος Νίκας είχε παραιτηθεί της υποψηφιότητάς του για την προεδρία της Ομοσπονδίας. Η ψηφοφορία εξελίχθηκε χωρίς απρόοπτα και με συμμετοχή όλων των εκπροσώπων των μελών της Γ.Σ.
Στις εργασίες της Γ.Σ., τις διεθνείς ποδοσφαιρικές αρχές FIFA και UEFA εκπροσώπησαν οι κ. Χέρμπερτ Χούμπελ και Μάριος Γεωργίου.
Στην εισαγωγική ομιλία του ο απερχόμενος πρόεδρος της ΕΠΟ κ. Ευάγγελος Γραμμένος ανέφερε, μεταξύ άλλων: «Φθάνοντας στο τέλος θέλω να ευχαριστήσω τα μέλη της Ε.Ε., των Επιτροπών και το προσωπικό της ΕΠΟ για τις υπηρεσίες τους στην υποβοήθηση του έργου της ΕΕ. Θέλω επίσης να ευχαριστήσω τις FIFA και UEFA και τα στελέχη τους για τη βοήθεια που μας προσέφεραν». Στην Εκτελεστική Επιτροπή εκλέχθηκαν τα έντεκα μέλη ανάμεσά τους και ο Λαρισαίος πρόεδρος της ΕΠΣΛ Δημήτρης Μπουχλαριώτης. Πρόκειται για τους: Αστέριο Αντωνίου (63 ψήφοι), Παναγιώτη Δημητρίου (59 ψήφοι), Γιώργο Χατζησαρόγλου (54 ψήφοι), Δαμιανό Γαβριηλίδη (53 ψήφοι), Δημοσθένη Κουπτσίδη (52 ψήφοι), Δημήτρη Μπουχλαριώτη (51 ψήφοι), Άγγελο Δανιήλ (47 ψήφοι), Παναγιώτη Παπαχρήστο (50 ψήφοι), Λεωνίδα Θωμαΐδη (50 ψήφοι), Κλέαρχο Τζαφέρη (49 ψήφοι) και Κυριάκο Φύτρα (48 ψήφοι).
Εκτός έμειναν όλοι διεθνείς που είχαν θέσει υποψηφιότητα στην Εκτελεστική Επιτροπή. Δηλαδή οι Δημήτρης Παπαδόπουλος (15 ψήφοι), Αγγελος Χαριστέας (14 ψήφοι), Γιώργος Ανατολάκης (14 ψήφοι) και Παντελής Καφές (13 ψήφοι). Επίσης εκτός έμειναν η Βίκυ Δημητρακοπούλου (από την ΕΠΣ Ηλείας) και ο πρόεδρος της ΕΠΣ Χανίων, Κώστας Κωνσταντίδης, που έλαβαν 16 και 13 ψήφους αντιστοίχως.
Να σημειωθεί ότι τη 17μελή Εκτελεστική Επιτροπή της ΕΠΟ (πέραν του Ζαγοράκη των 11 μελών) συμπληρώνουν ο πρόεδρος της Σούπερ Λίγκας 1 Λεωνίδας Μπουτσικάρης, ο ομόλογος του της Ένωσης SL2-FL, Λεωνίδας Λεουτσάκος και τρεις ακόμα εκπρόσωποι της SL1. Αυτήν τη στιγμή αυτοί είναι οι Τάκης Αγραφιώτης (Ολυμπιακός), Βαγγέλης Ασλανίδης (ΑΕΚ) και Μάκης Γκαγκάτσης (ΠΑΟΚ), αλλά για αυτές τις τρεις θέσεις θα υπάρξουν αρχαιρεσίες την προσεχή εβδομάδα για την ανάδειξη νέων εκπροσώπων της μεγάλης επαγγελματικής κατηγορίας.
Αναπληρωματικά μέλη της εκτελεστικής επιτροπής της Ε.Π.Ο. εκλέχθηκαν οι: Αυλωνίτης Νικόλαος 25, Βισβίκης Διονύσιος 36, Γιαρένης Δημήτριος 29, Διακοφώτης Παναγιώτης 53, Κορδολέμης Μιχαήλ 19, Σαρηγιαννίδης Σταύρος 37, Σπηλιώτης Βασίλειος 20, Σφήκας Αλέξανδρος 21, Τόκας Αστέριος 47, Τριανταφύλλου Δημήτριος 29, Χατζημαρινάκης Παντελής 31.
Πρόεδρος της επιτροπής ελέγχου και συμμόρφωσης της Ε.Π.Ο. εκλέχθηκε ο Μιχάλης Τσιχριτζής με 60 ψήφους και αναπληρωτής πρόεδρος ο Γιώργος Βούρβαχης με 50.
Τακτικά μέλη της επιτροπής ελέγχου και συμμόρφωσης της Ε.Π.Ο. εκλέχθηκαν οι: Αγγέλου Θεοφάνης 43, Πανίδης Αβραάμ 57, Παρούσης Γεώργιος 38, Φεργαδιώτης Ευστράτιος 54, Φιλιπποπολίτης Ιωάννης 37.
Αναπληρωματικά μέλη της επιτροπής ελέγχου και συμμόρφωσης της Ε.Π.Ο.: Ασημωτός Ευάγγελος 49, Γαλανός Μάριος 51, Σουπιός Ευστράτιος 49.
Τακτικά μέλη της εκλογικής επιτροπής: Αντωνιάδης Κωνσταντίνος 58, Θεοδωρόπουλος Σταύρος 49, Καρβούνης Χρήστος 49.
Αναπληρωματικά μέλη της εκλογικής επιτροπής: Κρανής Γεώργιος 51, Χρυσάφης Σταύρος 54.
Τακτικός εκπρόσωπος της Ε.Π.Ο. στην Ελληνική Ολυμπιακή Επιτροπή εκλέχθηκε ο Ψαρρόπουλος Σταύρος 53.
Αναπληρωτής εκπρόσωπος της Ε.Π.Ο. στην Ελληνική Ολυμπιακή Επιτροπή: ο Παπαχρήστος Παναγιώτης 56.
Πρακτικογράφοι οι: Μουρτζιλάς Στέργιος 59, Νικολαΐδης Κωνσταντίνος 57, Παπαδόπουλος Μιχαήλ 56.
Ψηφολέκτες: Σάββας Νικόλαος 59, Δημητριάδης Σάββας 56, Καρτσακλάς Θωμάς 56.