Στην 5η φάση θα λάβουν μέρος οι 16 ομάδες που θα προκριθούν από τους ομίλους της 4ης φάσης. Οι 8 ομάδες που θα καταλάβουν την πρώτη θέση σε κάθε όμιλο θα συγκροτήσουν το πρώτο γκρουπ δυναμικότητας και οι υπόλοιπες 8 ομάδες, που θα τερματίσουν στη δεύτερη θέση, θα συγκροτήσουν το δεύτερο γκρουπ δυναμικότητας.
Κάθε ομάδα από το πρώτο γκρουπ θα κληρωθεί με μια ομάδα από το δεύτερο γκρουπ, ωστόσο ομάδες που θα προκριθούν από τον ίδιο όμιλο, δεν θα αγωνιστούν μεταξύ τους.
Γηπεδούχοι στον πρώτο αγώνα θα είναι οι ομάδες του δεύτερου γκρουπ δυναμικότητας.
*Η ΑΕΛ την Τετάρτη 19 Δεκεμβρίου και ώρα 19:30 θα αγωνιστεί στο γήπεδο της Καλαμαριάς με τον Απόλλωνα Πόντου και θέλει νίκη ή ισοπαλία για να προκριθεί στην επόμενη φάση του Κυπέλλου Ελλάδος.